一株柯萨奇病毒A9分离株的VP1基因遗传特征分析
摘要：
目的分析引起病毒性脑炎(viralencephalitis,VE)的一株柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)A9分离株(CVA9)的VP1基因遗传特征。
方法采用KMB17细胞对VE患儿粪便标本进行病毒分离,利用RT-PCR法从分离的病毒中扩增VP1全基因,并测序,采用Mega6.1和Geneious5.6.5等软件分析其序列,并构建系统进化树。
结果从5份VE患儿粪便中分离到一株人CVA9,命名为A/YN/CHN/,其全长VP1基因的核苷酸长度与其他CVA9一致,均为bp。与中国其他分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为88.4%~98.2%和96.4%~99.3%,而与国外分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.0%~96.0%和92.7%~99.0%。在进化树上与其他中国分离株属同一分支中不同两个亚分支,与JB亲缘关系较近。
结论A/YN/CHN/分离株为肠道病毒CVA9血清型,与其他中国分离株同属一个基因簇。
关键词：柯萨奇病毒A9;VP1基因;遗传特征
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